2016 год нашей эры. Комплементация переходит в решающую фазу; скоро человечество переродится в новую форму жизни. Синдзи продолжает исследовать себя, своё сознание. Он представляет мир, в котором бы не был пилотом Евангелиона, а был бы простым мальчиком. В конце концов Синдзи начинает понимать, что нельзя вечно жить одному и прятаться от людей.