Michael Scofield látszólag rablást követ el, hogy bekerüljön a Fox River Állami Fegyintézetbe, ahol bátyját, Lincoln Burrowst hamarosan kivégzik egy bűncselekmény miatt, amit Michael szerint nem követett el. Michael terve az, hogy mindketten meg fognak szökni. A börtönön kívül Linc ex-barátnője, Veronica Donovan kezd nyomozni.