Le Docteur Hell lance un assaut de grande envergure contre le laboratoire photonique, utilisant notamment un monstre organique pour infecter l’organisme du robot Venus Ace ( que pilote Sayaka depuis le troisième épisode ). Celui-ci ne tardera pas à se retourner contre Kôji et ses compagnons. Une nouvelle attaque lui permet également de captuer Kôji et les autres. Grâce à Boss et à son Boss Borot qui font diversion, Kôji parvint à prendre le contrôle de Mazinkaiser, mais il doit faire face peu de temps après à un nouveau monstre mécanique d’une puissance considérable et capable de voler …