Lors d'une course sur Cybertron, Hot Rod réussit à surpasser toutes les autres voitures Autobots, dont Blurr, avec l'aide de Spike à la place du conducteur. L'Autobot Brainstorm déclare que les Autobots peuvent être encore plus efficaces que les opérateurs humains. Pendant ce temps, les Décepticans attaquent Autobot City dans le but de voler la clé de la chambre à plasma de Cybertron. Ils y réussissent, et Punch est sévèrement endommagé. Les Décepticans attaquent ensuite Cybertron et essaient d'accéder à la chambre à plasma, mais lorqu'ils essaient de l'ouvrir, dix Décepticans, menés par Cyclonus, et douze Autobots, dirigés par Hot Rod, ainsi que Spike et Daniel, sont projetés dans le monde lointain des Nébulons. La planète Nébulos comprend deux factions : les Hives, les mauvais Nébulons qui utilisent leur pouvoir mental pour se faire obéïr de leurs machines, dirigés par Lord Zarak, et leurs opposants, les bons Nébulons, qui détestent les machines et ne demandent qu'à vivre en paix. Chaque groupe de Transformers atterrit dans le camp qui lui correspond, mais les bons Nébulons manquent de détruire les Autobots parce qu'ils détestent les machines. Daniel est sévèrement blessé pendant la bataille, et les Autobots se rendent compte qu'ils doivent réagir lorsque six d’entre eux sont capturés par les Décepticans. Ils pensent se relier à quatre Nébulons, ainsi qu'à Spike et Daniel, pour devenir des Headmasters. Cérebros, un pacifiste, refuse de se relier à Spike, mais les autres réussissent l'opération avec succès, notamment Daniel relié à Arcee, ce qui lui sauve la vie.